L’équipe de Sylvain Latour est une équipe de renommée internationale dans le domaine des immunodéficiences primaires. L’équipe a développé au fil des ans une solide expertise dans l’identification et la caractérisation des déficiences immunitaires monogéniques héréditaires associées à une forte sensibilité à l’infection par le virus d’Epstein Barr (EBV) et aux lymphomes B induits par l’EBV, qui sont des maladies pédiatriques. Notamment, les études de ces déficits immunitaires primaires ont permis de découvrir de nouveaux facteurs / mécanismes clés impliqués dans la réponse immunitaire contre l’EBV, et plus généralement dans l’immuno-surveillance des lymphomes. Notamment, l’équipe a montré que l’expansion des cellules T est une étape clé de la réponse immunitaire à l’infection à EBV. L’équipe a récemment mis en évidence le rôle essentiel de deux récepteurs de co-stimulation (et leurs ligands respectifs) appartenant à la famille des TNF récepteurs que sont CD27 et son ligand CD70, et TNFRSF9 (aussi connu sous les noms de C137 et 4-1BB) et son ligand TNFSF9. Enfin, depuis plusieurs années, l’équipe s’intéresse aussi aux infections à EBV « atypiques », quand l’EBV infecte et persiste dans les lymphocytes T et NK ainsi que dans les cellules musculaires lisses conduisant à des lymphomes T/NK et des tumeurs du muscles lisses/léiomyomes.

L’équipe contribuera principalement au WP1 et collaborera étroitement avec les équipes de V. Asnafi et F. de Vathaire pour identifier de nouveaux facteurs de prédisposition génétique aux hémopathies malignes infantiles impliquées dans l’immunité et la lymphomagenèse à travers des analyses de patients. Dans ces études, les associations et interactions entre les mutations somatiques et germinales ainsi que le mode de prédisposition polygénique seront pris en compte (pour les nouveaux gènes et gènes, déjà connus pour être associés à un risque élevé de lymphome). Ces analyses comprendront l’identification de variants rares et moins rares, l’identification / calcul des scores de risque génétique associé à des voies de signalisation spécifiques. Selon leur fonction, de nouveaux gènes et voies pourraient être analysés en collaboration avec les équipes du WP2 et du WP3.

L’équipe a initié une collection de données d’exome de patients pédiatriques (avec des proches) ayant présenté un lymphome (projet PID-Ls et groupe EuroNet Hodgkin Lymphome) recrutés en collaboration avec le comité lymphome de la SFCE dirigé par T. Leblanc (projet PID-Ls et EuroNet Hodgkin Groupe Lymphome), le Centre d’Etude des Déficits Immunitaires (CEDI dirigé par Capucine Picard) et avec collaborations de l’équipe à travers le monde.

L’expertise et les compétences spécifiques de l’équipe sont :
   ● Recrutement de patients immunodéficients atteints de lymphome
   ● Séquençage WES, ciblage du séquençage d’exons
   ● Analyse des données WES
   ● Identification de variants génétiques rares
   ● Validation fonctionnelle des variants identifiés
   ● Analyse des réponses des lymphocytes T et signalisation
   ● Technologies basées sur CRISPR-Cas9 dans les lignées cellulaires et les modèles de souris, dont la correction des mutations à partir des cellules de patients
   ● Approches basées sur le ShRNA dans les lymphocytes
   ● Développement et analyse de souris imitant les variations identifiées chez les patients